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Text File  |  1995-03-04  |  1.5 KB  |  31 lines
  1. ***********************************************************
  2. * Cyclin-dependent kinases regulatory subunits signatures *
  3. ***********************************************************
  4.  
  5. Cyclin-dependent kinases  (CDK)  are  protein  kinases  which  associate  with
  6. cyclins to  regulate  eukaryotic  cell cycle progression.  The most well known
  7. CDK is p34-cdc2 (CDC28 in yeast) which is required  for entry into S-phase and
  8. mitosis.  The CDKs  bind  to a regulatory subunit which is essential for their
  9. biological function.  The  regulatory  subunit is a small protein of 79 to 150
  10. residues. In  yeast  (gene  CKS1)  and  in  fission yeast (gene suc1) a single
  11. isoform is known while mammals have two highly related isoforms.
  12.  
  13. It has  been  shown  [1]  that  these  CDK regulatory subunits  assemble as an
  14. hexamer hich  can  then  act  as  the  hub  for the oligomerization of six CDK
  15. catalytic subunits.
  16.  
  17. The sequence of CDK regulatory subunits are highly  conserved and we have used
  18. the two most conserved regions as signature patterns.
  19.  
  20. -Consensus pattern: Y-S-x-[KR]-Y-x-[DE](2)-x-[FY]-E-Y-R-H-V-M-L-P-[KR]
  21. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  22. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  23.  
  24. -Consensus pattern: H-x-P-E-P-H-I-L-L-F-[KR]
  25. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  26. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: NONE.
  27. -Last update: June 1994 / First entry.
  28.  
  29. [ 1] Parge H.E., Arvai A.S., Murtari D.J., Reed S.I., Tainer J.A.
  30.      Science 262:387-395(1993).
  31.